渐冻症（即运动神经元病）因运动神经元进行性退化，导致全身肌肉逐渐失去神经支配，进而引发多系统并发症，严重威胁患者生活质量与生命安全，主要包括以下几类：
呼吸功能相关并发症
这是最常见且致命的并发症。随着膈肌、肋间肌等呼吸肌逐渐萎缩无力，患者初期表现为活动后气短，后期静息时也会出现呼吸困难，最终发展为呼吸衰竭。同时，呼吸肌无力导致咳嗽、排痰能力显著下降，痰液易淤积在肺部，引发反复肺部感染（如肺炎），出现发热、咳嗽、咳痰等症状，进一步加重呼吸功能损伤。
吞咽与营养相关并发症
咽喉部肌肉受累会导致吞咽功能障碍，患者进食时易发生呛咳，液体和固体食物均可能误吸入气管，诱发吸入性肺炎。吞咽困难还会导致进食量减少，长期下来引发营养不良、体重骤降、贫血等问题，使身体免疫力持续降低，更易受到各类感染侵袭。
运动与骨骼相关并发症
四肢肌肉进行性萎缩无力会逐步剥夺患者的活动能力，长期卧床或久坐易导致臀部、足跟等骨突部位出现压疮（褥疮），严重时皮肤破溃、感染，甚至引发骨髓炎。此外，肌肉无力导致关节活动减少，会引发关节僵硬、挛缩，进一步限制活动范围，形成 “肌肉萎缩 — 活动受限 — 挛缩加重” 的恶性循环。
其他并发症
部分患者会因身体功能急剧丧失、生活无法自理及对疾病的担忧，出现焦虑、抑郁等心理问题。少数患者还可能因神经病变影响自主神经功能，出现便秘、尿潴留等症状。
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